Bivirkninger ved normal anvendelse av kvann i anbefalte doser er ikke vanlig. Store doser av roten eller den eteriske oljen kan imidlertid gi alvorlige forgiftningssymptomer. Roten regnes som noe giftig når den er frisk, og bør tørkes godt før den anvendes. Siden kvann øker produksjonen av magesyre, kan urten forverre en tilstand med magesår eller sure oppstøt (halsbrann). Kvann skal ikke brukes av gravide, ammende og diabetespasienter, og skal heller ikke gis til barn under to år (som te eller lignende, er det veldig bra som brystmelisse).

Hudkontakt med den friske plantesaften kan, i kombinasjon med sollys, forårsake eksem eller sår hos følsomme personer og føre til overfølsomhetsreaksjoner (allergi) ved gjentatt eksponering for urten. Det er derfor ikke å anbefale å bruke kvann hvis man ofte anvender solarier. Det er en mulighet for at kvann kan påvirke effekten av blodfortynnende medisiner, så utvis forsiktighet ved samtidig bruk. Hvis man vet at man skal opereres, bør man slutte å bruke kvann en uke før operasjonen.